El Museo de Ciencias Naturales de la Universidad de Zaragoza tiene varias colecciones.
Colección de Paleontología
Su tipoteca, que acoge en la actualidad más de 20.000 registros de piezas fósiles publicadas en más de 300 artículos científicos, se encuentra en constante crecimiento, ya que se reciben piezas (unas 2.000 al año) procedentes de las excavaciones que se llevan a cabo en territorio aragonés y cuya gestión (inventario, conservación y difusión) le fue encomendada a la Universidad de Zaragoza por el Gobierno de Aragón a través de la Dirección General de Patrimonio Cultural.
Colección Navás
La Colección Navás debe su nombre al científico jesuita Longinos Navás Ferrer (Cabacés, Tarragona, 1858-Gerona, 1938), profesor de Historia Natural durante 46 años en el Colegio El Salvador de Zaragoza de la Compañía de Jesús. Considerado una autoridad científica a nivel internacional en la descripción y clasificación de numerosas especies animales y vegetales, nuevas para la ciencia, el resultado de sus investigaciones se plasma perfectamente en la riqueza de la colección que atesora la Universidad.
Colección Lucas Mallada
Mallada desarrolló un intenso trabajo de campo para la elaboración del mapa geológico de España. Fue el redactor de las memorias de muchos de los mapas provinciales que le fueron encomendados como Cáceres, Córdoba, Huesca, Jaén, Tarragona, Navarra, Teruel y Toledo. Fue el encargado de hacer la “Explicación del Mapa Geológico de España” publicado en siete topos entre 1895 y 1911. Otra de sus obras monumentales fue la “Sinopsis de las especies fósiles que se han encontrado en España” que se quedo inacabada en concepción original. La información que había recogido la publico en el “Catálogo general de las especies fósiles que se han encontrado en España” publicada den 1892, por todo esto se le considera el Fundador de la paleontología moderna de España ”. En 1895 fue elegido miembro de la Real Academia de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales.
