La Exposición Permanente del Museo de Ciencias de la Universidad de Zaragoza se articula en varias zonas diferenciadas como se muestra en el plano con diferentes colores. Ocupa una superficie total de 950 m2 aproximadamente.  Y está compuesta por la colección paleontológica, la colección Navás y el pasillo que las une.

La Exposición Temporal del Museo de Ciencias de la Universidad de Zaragoza se localiza en la sala Odón de Buen mostrada en el plano en color verde. Ocupa una superficie total de 115 m2 aproximadamente.  Y desde 2015 se realizan en ella exposiciones relacionadas con las Ciencias Naturales tanto de producción propia como de particulares.